کشف قلمرو میکروب‌های ناشناخته در روده انسان

اخیرا یک مطالعه جدید این نکته را مورد اشاره قرار داده است که برخی از این اشکال ناشناخته ممکن است به ما بسیار نزدیکتر از آنچه تصور می‌شود باشند؛ جایی در داخل روده انسان.

در طول 10 سال گذشته درک این که ما همواره یک اکوسیستم غنی از میکروب‌ها را همراه خود جابه‌جا می‌کنیم و این موجودات، بخش تمام و کمالی از زیست‎شناسی ما هستند، نگاه ما به انسان را تغییر داده است. میکروبیوم انسان مجموعه‌ای از میکروب‌ها شامل باکتری‌ها، قارچ‌ها و ویروس‌ها هستند که در روده، دهان و حتی هوای اطراف ما زندگی می‌کنند، ما را تحت تاثیر قرار می‌دهند و در عملکرد ما نقش دارند.

از آنجا که میکروب‌هایی که در روده ما زندگی می‌کنند برخی از بهترین نمونه‌های مطالعه شده در جهان علم هستند، این قسمت برای شروع مطالعات در زمینه کشف ماده تاریک حیات نقطه مناسبی به نظر می‌رسید. محققان معمولا با استفاده از آنالیز DNA گونه‌های جدید را براساس ژنوم منحصر به فردشان شناسایی می‌کنند ولی در مورد باکتری‌ها مسأله، اندکی دشوارتر است؛ چرا که باکتری‌ها اغلب بخش‌هایی از DNA خود را با هم به اشتراک می‌گذارند. انتقال این ژن‌ها، شناسایی، تشخیص و ردیابی گونه‌های باکتری را با دشواری روبه‌رو کرده است.

در مطالعه جدیدی که در Biology Direct به چاپ رسیده است، محققان تصمیم گرفتند برای غلبه بر این مشکل بر روی آن دسته از ژن‌هایی که معمولا در بین میکروب‌ها منتقل نمی‌شوند تمرکز کنند.

آنها حدودا 230 هزار پروتئین از DNA را کشف کردند که به 86 خانواده ژنی شناسایی شده مرتبط بود. این نقطه شروع تحقیق بود و در آنالیز بعدی آنها 80 هزار توالی دیگر از DNA را پیدا کردند که به همان 86 خانواده مرتبط بود. محققان دریافتند که حدود یک سوم از این پروتئین‌های DNA تنها در 60 درصد از بازها و توالی‌های خود مشترک‌اند. این درجه از تفاوت چیزی است که معمولا بین باکتری‌ها و آرک‌ها یافت می‌شود که هر کدام به یک قلمرو از موجودات زنده متعلق‌اند.

در حال حاضر سه قلمرو از موجودات زنده داریم: یوکاریوت‌ها (شامل حیوانات، گیاهان و قارچ‌ها )، باکتری‌ها و آرک‌ها. به این ترتیب این باکتری‌ها با این میزان تفاوت در توالی‌های ژنی می‌توانند به طور بالقوه به عنوان چهارمین دامنه یا قلمرو موجودات زنده در نظر گرفته شوند.

با این حال محققان هشدار می‌دهند با این که این یافته‌ها کاملا مشخص و واضح‌اند اما بهتر است درباره نتیجه‌گیری از این یافته‌ها هوشیار باشیم. تفاوت‌های خیلی زیاد بین توالی‌های DNA می‌تواند به سادگی نشان‌دهنده تنوع و تفاوت زیادی باشد که در حال حاضر بین باکتری‌ها و آرک‌ها وجود دارد تا این که یک قلمرو جدیدی از حیات محسوب شود. محققان می‌گویند که مرحله بعدی تحقیق آنها شامل شناسایی برخی از موجودات زنده که حاوی این توالی‌های غیر معمول هستند و بعد تعیین توالی ژنوم کامل آنهاست.

انتهای پیام